比赛场地
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主条目：2020年夏季奥林匹克运动会和夏季帕拉林匹克运动会比赛场馆列表
本届奥运的主场馆：位于东京霞丘的国立竞技场
东京圈内33个会场中的28个会场集中在奥运村半径为8公里的范围内，新建11个场馆为永久设施，11个场馆为临时设施[23]。
东京奥运最终预算为1兆3,500亿日圆（折合约126亿美元）[24]。
遗产区域
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遗产区域（日语：ヘリテッジゾーン，英语：Heritage Zone）位处东京市区、晴海选手村的西北方，区域内的比赛场馆多延用1964年东京奥运所使用的场地或其他固有竞技场地，并加以改建或翻修而成。其中新落成的国立竞技场在奥运会期间暂用“奥林匹克竞技场”代称。
奥林匹克竞技场
东京体育馆
国立代代木竞技场
日本武道馆
东京国际论坛
两国国技馆
马事公苑
武藏野之森综合体育广场
东京体育场
武藏野之森公园
东京湾区域
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东京湾区域（日语：東京ベイゾーン，英语：Tokyo Bay Zone）涵括所有环东京湾的场地，位于晴海选手村的东南方，多数为新建或临时场地。
有明体育馆
有明体操竞技场
有明都市运动公园
有明网球森林公园
御台场海滨公园
潮风公园
青海都市运动公园
大井曲棍球竞技场
海之森越野场
海之森水上竞技场
轻艇激流中心
梦之岛公园射箭场
东京水上运动中心
东京辰巳国际游泳场
幕张展览馆
其他地区
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大通公园
钓崎海岸冲浪沙滩
埼玉超级竞技场
陆上自卫队朝霞训练场
霞关乡村俱乐部
江之岛游艇港口
伊豆自行车馆
伊豆登山车赛场
富士国际赛车场
福岛县营吾妻球场
横滨棒球场
足球场地
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奥林匹克体育场
东京体育场
札幌巨蛋
宫城体育场
茨城县立鹿嶋足球场
埼玉2002体育场
横滨国际综合竞技场
东京Big Sight夜景
非比赛场馆
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东京帝国饭店 - IOC本部
晴海选手村
东京Big Sight - 媒体新闻中心、国际转播中心
志愿者
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志愿者招募于2018年9月26日正式开始。截至2019年1月18日，东京奥组委共收到204,680份申请。2019年1月30日，国际奥委会公布东京奥运会志愿者的正式名称：服务赛场的志愿者被称为“Field Cast”，服务城市的内志愿者被称为“City Cast”[25]。志愿者的遴选工作于2019年2月正式开始。
2020年2月22日，据路透社报道，受2019冠状病毒病疫情影响，东京奥委会推迟了原定于当天开始的志愿者培训工作。东京奥组委强调推迟不会对其他工作造成影响[26]。
安保工作
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2018年12月，东京都政府宣布禁止无人机在奥运会场馆上空飞行[27]。
防疫安排
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主条目：2019冠状病毒病疫情对东京奥运会的影响
参见：2019冠状病毒病日本疫情
2021年3月20日，日本政府宣布由于2019冠状病毒病疫情（COVID-19）仍然持续及出现变异病毒，日本政府原则上需要拒绝外国人的新入境，因此本届夏季奥运会及帕拉林匹克运动会将是近代史上首次没有海外现场观众的奥运会[28][29][30][31]。
2021年5月6日，日本政府及国际奥委会宣布已经与美国辉瑞制药和德国BioNTech达成协议，由辉瑞制药向本届夏季奥运会及帕拉林匹克运动会的各国代表团送出辉瑞－BioNTech 2019冠状病毒病疫苗[32]，这些疫苗将于5月底前送交到各国代表团，以便在前往东京前可完成接种两剂疫苗。国际奥委会表示鼓励参赛者及工作人员接种疫苗，但不会强制接种[33]，接种疫苗属自愿性质[34]，东京奥运组委会向运动员及传媒发出的指引亦指出接种疫苗并不是前往东京的条件[35]。
2021年5月28日，日本政府与东京奥运暨帕运组织委员会商讨现场观众的入场安排，以应对疫情持续甚至扩大的情况，包括将已售出门票进行抽签，进一步减少入场观众的人数，如果疫情扩大或需要闭门作赛，即使已经购票的日本观众也不能入场观赛[36]。
2021年6月20日，东京都政府决定，在东京奥运会及残奥会期间，取消所有公众观赛活动。[37]
2021年7月8日，日本首相菅义伟正式宣布，第四次针对2019冠状病毒病疫情向东京都发布紧急事态宣言[38]，时间范围为7月12日至8月22日，涵盖整个奥运会期间，这也意味着东京奥运会确定将全程在紧急事态下举办[39][40][41][42]。对此，日本奥运担当大臣丸川珠代表示，东京奥运会基本上不会对任何普通观众开放，比赛空场举行[43]。同日，国际奥委会、国际残奥会、东京奥组委、日本政府、东京都政府召开五方会谈，共同宣布包含主办地东京都在内的一都三县（东京、千叶、埼玉、神奈川）之比赛场地采取无观众比赛，不安排观众进入比赛场馆[18][19][20]。
2021年7月9日，北海道政府通知东京奥组委，由于其担心以有观众的方式举办赛事，可能会导致民众从各地前往北海道观赛，导致疫情蔓延，故东京奥组委宣布在札幌穹顶体育场举行的足球赛将以无观众形式举行[44]，在札幌举办的马拉松、竞走等赛事也被要求禁止沿途观看比赛。至此，在北海道举办的奥运赛事将全部以无观众形式举行。[45]
2021年7月10日，福岛县政府在前日通知东京奥组委，考虑到日本全国的疫情形势，也借鉴其他地区采取的防疫措施，他们已经决定在县营吾妻球场举办的东京奥运会垒球和棒球比赛将不允许观众入内，从有观众举办突然转变为无观众举办[46]。对此，东京奥组委表示只能“遗憾地”接受相关决定，并希望因此而受到影响的观众对此做法予以理解[47]。至此，允许观众观看的奥运会比赛只剩下场地自行车和足球两个项目，赛场只剩下三个[48][49][50]。
2021年7月16日，东京奥组委公布了防疫准则，要求各国运动员禁止握手或拥抱，以避免不必要的肢体接触，甚至严禁选手们性交。但这项政策却引发部分选手不满。年届52岁的德国前跳远名将苏森·蒂德克（英语：Susen Tiedtke）即表示，“选手们以‘这种方式’发泄精力是很正常的事情”。疫情下的东京奥运估计将有11000位运动员参加，各国选手齐聚于奥运盛会除了在赛场上拼成绩、为国家争光外，在选手村里彼此交流也向来相当热络。据东京奥组委表示，由于全球疫情尚未消退，本届东京奥运为了避免爆发群聚感染，严禁运动员在奥运期间发生性行为，但仍依照过往惯例，提供选手村15万个安全套，并告知选手这些安全套可作为纪念品，相比上届的里约奥运，本届奥运发放的安全套数量足足少了29万个。此外，本届东奥讲求环保，选手村内的床架首创以厚纸板制成。[51][52]
此外，国际奥委会主席托马斯·巴赫日前受访时也透露在东京奥运会的颁奖仪式上，颁奖者将在赛场上等待运动员，而不是与运动员一起出场，也不会在颁奖期间用握手、拥抱等方式予以祝贺。奖牌和礼物则被放在一个托盘里，颁奖者把托盘拿给获奖运动员，由运动员取走托盘内的奖牌和礼物（即“自助式颁奖”），整个过程双方都不可以有身体接触。另外，每个运动员都只能待在自己的领奖台上，颁奖结束后，运动员们也不能在领奖台上合影留念。[53]
2021年7月21日，东京奥组委透露，因应防疫需要，参加23日在国立竞技场举办的东京奥运会开幕式的人士目前预计约为950人，其中日本国内的相关人士约150人，外国人士800人，其中包括法国总统马克龙和美国第一夫人吉尔·拜登[54][55]。开幕式仍实施空场方式，不安排其他观众进入开幕式现场。[56]